傳說創界主伊域創造了四個世界，天界、創界、天使界和人界，並且宣稱自己是世界的主宰，同時是四個世界所有生物的創造者，並在物質界創立伊域聖教，派遣其下的七大御前天使(7位天使)、黃道十二宮天使(12位天使)、聖教御封士(人類)在物質界不斷地屠殺不肯信奉和臣服伊域聖教的人類。三位被伊域聖教殺死了親人的少年-----修羅．他化自在天、彼特．法蘭菲勒、奧利昂．尤利斯坦，他們三人立下志向要向創界主報仇並瓦解伊域聖教，一步一步地和伊域聖教派出的天使和聖教御封士戰鬥，最後打敗七大御前天使並且突破九重天來到創界主的所在地----創界。最後發現所有事情的幕後黑手都是創界主的母親聖母瑪俐．亞當和大邪神----命運弄出來的。


第一部:梵帝剛篇:
修羅．他化自在天、彼特．法蘭菲勒、奧利昂．尤利斯坦，前往梵帝剛教庭要殺教宗以諾三十三世，最後和梵帝剛的守護者米迦勒決戰，但三人發現實力遠遠不如米迦勒，最後不敵米迦勒並逃離梵帝剛。


第二部:物質界篇:
修羅和米迦勒戰鬥之後身受重傷，最後昏迷不醒。此時在修羅面前出現了女主角雪倫．希爾杜，並告訴他修羅的前世就是四大鬼王之一的修羅王。另一方面黃道十二宮天使接到創界主的聖旨要殺死修羅等人。


第三部:殺神山莊篇:
殺神山莊舉辦了比試大會，冠軍可以得到能夠消滅創界主的殺神劍。修羅．他化自在天、彼特．法蘭菲勒、奧利昂．尤利斯坦、雪倫．希爾杜因此前往殺神山莊參加殺神山莊舉辦的比試大會。


第四部:修煉篇:
修羅獨自一人前往卍慈佛國找尋卍慈教的教主童瑤，希望進一步了解自己的前世。另一方面彼特、雪倫和奧利昂來到魔法界修煉，認識了一位7歲的貓妖魔法少女---貓咲立立，在和立立相處的過程中彼特發現貓咲立立居然是男生?


第五部:羅潔愛兒之書篇:
奧利昂發現天使羅潔愛兒寫的羅潔愛兒之書居然隱藏能夠消滅創界主的方法。另一方面修羅在修煉的途中結識了四位可愛的美少女，那維亞．西克斯、美雅．貝林西撒、法瑞娜．貝林西撒和四道離生，最後修羅發現法瑞娜．貝林西撒瑞居然是宙斯的媽媽瑞亞的轉世?


第六部:希臘神話篇:
普羅米修斯希望佳亞的轉世美雅．貝林西撒可以協助他一起消滅宙斯。另一方面奧利昂一行人在魔法界遇上被宙斯施加了詛咒的奈莎娜，為了幫助奈莎娜解除詛咒，奧利昂一行人決定挑戰希臘眾神，最後消滅宙斯。


第七部:魔玩對戰篇:
為了得到寒冰煉獄劍，彼特、貓咲立立、那維亞、法瑞娜、雪倫和奧利昂一起參加由魔法界舉辦的魔玩對戰比賽，那是一個由契約者和契約獸一起參加的卡片遊戲對戰比賽。


第八部:鬼魅王爭霸戰篇:
為了選出新一任魔界之王，魔界每一千年都會舉辦武鬥比賽，今屆的比賽稱為鬼魅王爭霸戰，冠軍能夠得到魔界、地界、墮天界承認的「鬼魅王」的稱號，魔界之王路西法邀請修羅一行人參加今次的鬼魅王爭霸戰，到底最後誰會成為新一任魔界之王?


第九部:冥界篇:
雪倫死後修羅最後才發現自己最愛的人是她。此時奧利昂告訴修羅自己就是冥王奧斯利斯的轉世，並且有辦法把修羅傳送到冥界找回雪倫的靈魂。


第十部:創界篇:
影夜發現創界主的真正身份是聖母的左手和大邪神命運的細胞結合而誕生的終極怪物。另一方面增強了實力的修羅一干人等終於來到天界挑戰七大御前天使。在突破九重天最後來到創界後，創界主伊域突然變成一隻有六隻手並且只有上半身的白色巨人怪物!!


第十一部:命運篇:
時間守護者水崎菜菜查出了世界的真相，原來所有世界包括六道輪迴都是被一部叫做「命運之輪」的機器管理著，而每一個世界都有一個叫「命運」的管理員，物質界的「命運」被自身的自私邪念和慾望支配演化成為「大邪神命運」。在消滅創界主之後，修羅一干人等和命運的最終戰鬥終於展開。